En 2014, la phase de désignation et de mise en place des outils de gestion est quasi achevée. Désormais, le réseau français de sites Natura 2000 comprend 1758 sites pour 12,6 % du territoire métropolitain soit 6,9 millions d’hectares hors domaine marin qui représente 4,1 millions d’hectares et 209 sites (source Ministère de l’Ecologie, 2014). Afin que les partenaires s’approprient les enjeux de Natura 2000, la France a choisi la concertation : citoyens, élus, agriculteurs, forestiers, chasseurs, pêcheurs, propriétaires terriens, associations, usagers et experts sont associés à la gestion de chaque site.
La gestion des sites est contractuelle et volontaire, offrant la possibilité aux collectivités locales et aux usagers de s'investir dans leur gestion dans le cadre de l'élaboration des documents d'objectifs (DOCOB). Un soutien financier et des exonérations fiscales sont prévus pour encourager la mise en oeuvre d'actions décrites dans le DOCOB, via les contrat Natura 2000, la charte Natura 2000 et les Mesures Agri-Environnementales (MAE) Natura 2000. En parallèle, la politique française intègre une partie réglementaire dans le cadre de l'évaluation des incidences.
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